GRASS/R
Tato stránka je věnována propojení GRASS GIS a R.
R je programovací jazyk a prostředí určené pro statistickou analýzu dat a jejich grafické zobrazení. Jde o implementaci programovacího jazyka S pod svobodnou licencí. R již předstihlo počtem uživatelů komerční S a stalo se faktickým standardem v řadě oblastí statistiky.
Používá se z příkazové řádky, existuje však několik frontendů s grafickým rozhraním jako RKWard, R Commander nebo rozšíření do OpenOffice.org Calcu R4Calc.
R bývá také propojováno či využíváno v komerčních softwarech, např. v prostředí PASW mohou uživatelé přímo psát a spouštět programy v jazyce R nad otevřenými daty.
Další informace na wikipedii.
Balíčky pro analýzu geoprostorových dat
R nabízí až více než 2000 různých rozšíření (tzv. balíčku) specializovaných na různé analýzy dat. My se zaměříme na balíčky určené pro práci s geoprostorovými (většinou obrazovými) daty.
- sp - základní balíček definující třídy a metody pro práci s prostorovými daty
- maptools - manipulace s prostorovými objekty
- maps - vykreslování map
- spatial - Kriging
- spatstat - analýza bodových výskytů
- splancs - analýza bodových výskytů v čase
- spdep - autokorelace prostorových objektů
- gstat - geostatistické modelování
- geoR - analýza geostatistických dat
- fields - analýza geoprostorových dat
- spatialCovariance - výpočet kovariační matice prostorových dat
- RArcInfo - import dat ve formátu ArcInfo Coverage
- shapefiles - čtení a zápis ESRI Shapefile
- RColorBrewer - tabulky barev optimalizované pro tématické mapy
- spgrass6 - rozhraní pro GRASS GIS 6+
| Datový typ | Třída | Rodičovská třída |
|---|---|---|
| body | SpatialPoints | Spatial |
| pixely | SpatialPixels | SpatialPoints |
| mřížka | SpatialGrid | SpatialPixels |
| linie | SpatialLines | Spatial, Line |
| hranice | SpatialRings | SpatialLines |
| polygon | SpatialPolygons | Spatial, Polygon |
spgrass6
Spgrass6 je rozšířením balíčku sp a je koncipován jako rozhraní pro moduly GRASS GIS 6. Přístup k datům v nativním formátu GRASS je zajištěn balíčkem rgdal.
Instalace
$ R
> install.packages(c("sp", "rgdal", "spgrass6"), dependencies = TRUE)
Spuštění
Z příkazové řádky GRASS GIS spustíme interpret R.
GRASS 6.5.svn (nc_spm_08):~ > R
Dále nahrajeme balíček spgrass6 a všechny jeho závislosti.
> library(spgrass6)
Loading required package: sp Loading required package: rgdal Geospatial Data Abstraction Library extensions to R successfully loaded Loaded GDAL runtime: GDAL 1.7.0dev, released 2008/11/26 Path to GDAL shared files: /usr/local/share/gdal Loaded PROJ.4 runtime: Rel. 4.6.1, 21 August 2008 Path to PROJ.4 shared files: (autodetected) Loading required package: XML GRASS GIS interface loaded with GRASS version: 6.5.svn and location: nc_spm_08